“十一五”以来，我院基本建设工作落实“提升能力、谋划未来，以科技创新支撑现代农业发展”的工作任务，以科技创新平台建设为核心，以支撑科技创新能力提高为目标，坚持以研为本，科学谋划，不断提高基本建设管理水平，努力实现基本建设跨越式发展，取得了丰硕成果，为全院各项事业快速发展提供了有力支撑。
一、规划管理制度日趋完善。强化规划引领发展的工作思路，编制了《中国农业科学院基本建设规划（2011-2020年）》、《中国农业科学院“十二五”基本建设规划》、《中国农业科学院院部大院控制性详细规划》、《中国农业科学院马连洼三所总体规划》、《中国农业科学院南口基地总体规划》。其中《中国农业科学院基本建设规划（2011-2020年）》是全院第一部指导农业科研基础条件建设的长期规划，对院属单位“十二五”期间科研平台建设和重大项目申报具有重要指导意义。
制定了《中国农业科学院基本建设管理办法（试行）》、《中国农业科学院综合试验基地建设项目管理办法》、《中国农业科学院基本建设项目实施关键点控制图》、《基本建设管理“八要八不”》、《中国农业科学院基本建设项目申报、验收全过程示范文本（试行）》、《中国农业科学院设计、监理、施工总承包招标文件示范文本（试行）》等制度和规范，并编制了《基本建设管理文件选编》，促进了在建项目的规范化管理。
二、重大科研基础设施快速推进。中国农作物基因资源与基因改良重大科学工程通过验收；农产品质量标准与检验检测中心、航天育种工程、研究生公寓完成建设；中国农业科学院图书馆扩建、国家农业生物安全科学中心、哈尔滨兽医研究所综合实验室和兰州兽医研究所综合实验室正在加紧建设；国家畜禽改良研究中心正在设计。
三、所区建设和科研办公环境明显改善。上海兽医所、烟草所、麻类所、棉花所通过集中建设，实现了新所区搬迁；哈兽研、特产所正在进行新所区建设；中关村院区和马连洼院区完成了院部办公楼、西大门、大院绿化改造工程、大院电力增容改造及外电源工程、大院地下管网基础设施改造工程、旧办公楼修缮、 马连洼院区综合改造、院部联建住宅、马连洼住宅等建设项目，面貌焕然一新。
四、试验基地（台站）建设有力。确立了“两重点一适度”的试验基地建设思路，即，重点推进综合性试验示范基地，重点推进满足区域布局要求的试验基地，适度支持一般性的专业基地。已建成廊坊、昌平南口、昌平马池口等7个试验基地以及呼伦贝尔、洛阳、德州、寿阳等9个野外科学观测台站，正在建设海南三亚、新疆阿克苏、青海平安、河南新乡等基地，云南大理、江苏南京等基地正在设计中。
五、质检体系极大完善。新建（改造）部级农产品质检中心17个和区域农产品质检中心1个，极大地完善了我院及我国的质检体系，提升了农产品检测能力。
六、在建项目执行进度明显加快。建立全院在建项目月报、通报、约谈制度，实行在建项目执行进度与新项目申报、年度投资申请挂钩制度，建立在建项目例行检查指导制度，全面推进在建项目建设进度。“十一五”期间全院下达国家投资较“十五”期间增长49.5%，建成科研用房27.7万平方米，科研辅助用房8.5万平方米，改造各类实验用房（畜禽舍等）5.9万平方米，温网室4.2万平方米，购置科研仪器设备 7897台（套）。2008年全院在建项目由115个下降到86个，2009年由118个下降至70个，2010年由70个下降到59个。
为进一步明确“十二五”期间我院基本建设的发展目标，全面实现我院基本建设由生存型向发展型的历史性转变，为我院大幅、快速、可持续提升自主创新能力提供更加有力的物质支撑，组织制定了我院基本建设“十二五”期间的发展思路。
一、明确“一条主线”。紧紧围绕我院“三个中心 一个基地”战略目标，以支撑自主创新能力提升为核心，支撑九大学科群建设，大力推动重大科技设施和科技平台建设，全面实现基本建设三项重要转变，即基本建设从生存型向发展型转变，基本建设管理由经验式向科学化转变，建设项目申报由自由滚动式向规划引导式转变。
二、牢记“两个坚持”。一要坚持“以研为本”。以支持自主创新能力提升为核心，整体提升我院实验室条件与设施装备水平，重点建设5个具有国际一流实验条件与设施装备的综合性研究平台，实现我院“九大学科群”创新基础设施的整体提升；坚持农业主产区、生态区导向，重点建设12个规模效益明显、地域布局急需、专业功能突出的试验基地，基本实现我院试验基地战略布局和体系化建设；加快完善院所基础设施，重点打造3-5个基础设施条件在国内外有较强示范性的现代科研院所。二要坚持“以人为本”。推进基本建设管理人才队伍建设，通过引进、培养、交流等方式，构建一支50人左右的骨干队伍，在全院范围内统筹使用；遴选8个左右基本建设项目作为管理示范工程，通过示范工程管理培养人才、积累经验；从规划设计与建设管理两个层面推进院所建设，构建和谐、宜居环境。
三、抓好“两优一快”工程。优先加强重大科技平台基础设施建设，优先加强综合试验基地、地域布局型试验基地建设，快速推进现代科研院所基础设施建设进程。通过实施“两优一快”工程，实现重点学科领域、优势学科领域创新基础设施的显著提升，基本完成我院试验基地布局和体系化建设，大幅改善科研院所基础设施条件，使我院科研基础条件支撑体系与综合保障能力实现跨越式发展，为推进“三个中心一个基地”建设迈上更高层次提供坚强有力的物质保障，具体任务如下：
——重大科技平台基础设施建设任务。重点推进国家生物安全科学中心、国家畜禽改良研究中心、哈尔滨兽医研究所综合实验室、兰州兽医研究所综合实验室、中国农业科学院图书馆等项目的建设；推进国家作物种质资源库等项目的筹划和立项。依靠重大项目的筹划与建设，使我院重大项目投资所占比例大幅上升，科技平台支撑能力显著增强。
——试验基地布局与建设任务。重点新建3个能够进行多学科、大规模试验的国家级综合试验示范基地，黄淮海国家农业综合试验示范基地（新乡）、华南现代农业综合示范基地（深圳）、东北平原国家农业综合试验示范基地（黑龙江垦区、吉林），2个能够解决我院地域布局型基地（南繁、北繁）和7个专业功能突出的试验基地（现代农业、云南、江西、茶叶、烟草、农机、特产）；依靠试验基地布局结构的调整与建设，实现我院农业科研、野外观测、示范推广等科技创新链条的纵向、横向一体化，在基地规模总量上再上一个新台阶。
——现代科研院所基础设施建设任务。以全面增强科研院所的可持续发展能力为目标，重点打造3-5个基础设施在国内外有较强示范性的现代科研院所，兼顾院所均衡发展，基本解决我院部分研究所实验室条件和设施装备差，业务用房不达标，院所区基础设施老化、不配套等问题，逐步完善院所信息化，整体推进创新设施精良、配套设施完善、支撑体系完整的现代化科研院所基础设施建设。
——基本建设管理能力建设任务。继续在队伍建设、示范工程、管理创新和制度建设四个方面着力，力争“十二五”末，在全院打造一支50人左右规模的基本建设管理骨干队伍；“十二五”期间打造8个左右的示范工程，力争每个片区都有一个示范工程，院本级项目全部纳入示范工程；进一步巩固和深化“规范管理年”活动成果，加强片区互助管理和全院人才统筹使用机制的探索与完善，加强工程质量和进度管理创新，探索质量溯源方式和跟踪管理方式，进一步完善基本建设制度，加强制度的宣传和贯彻；加强基建档案的管理。
