近日，中国农业科学院棉花研究所研究团队改进了挖掘数量性状位点（QTLs）常用的结合高通量测序的混合分组分析法（NGS-BSA），进一步提高了定位QTLs的分辨率和稳定性，并利用该方法成功挖掘出与陆地棉衣分相关的QTLs及候选基因，为进一步提高陆地棉产量奠定了理论基础。相关研究成果发表在《理论和应用遗传学（Theoretical and Applied Genetics）》。
NGS-BSA是一种利用分离群体中表型差异较大的两组个体构建混池，快速定位QTLs的遗传分析方法。以往的NGS-BSA主要以杂种二代群体（F2）作为作图群体，但仅利用单个F2作图群体进行NGS-BSA鉴定的连锁标记存在分辨率低、所获QTLs稳定性较差等问题，无法广泛应用于标记辅助选择和作物改良。
该研究利用陆地棉F2及其家系群体进行混合分组分析，提高了QTLs鉴定的分辨率。此外，该研究利用NGS-BSA对2个或更多的半同源F2群体所获得的候选区间进行关联，可获得稳定的QTLs，并成功建立了半同源群体QTL-seq关联分析方法。利用该方法，研究人员成功鉴定到一个与陆地棉衣分显著相关的QTL，并对候选基因GhIQD14在双亲间的变异及其对陆地棉衣分的调控差异进行了解析。研究结果为改良陆地棉衣分提供新思路，为陆地棉纤维产量与品质的协同改良及种质创新奠定理论基础。
该研究得到国家自然科学基金、新疆维吾尔自治区自然科学基金等项目的资助。（通讯员 梁冰）
原文链接：https://doi.org/10.1007/s00122-022-04181-1
