近日,中国农业科学院农业基因组研究所与棉花研究所合作,系统绘制了控制棉纤维发育的基因调控网络,揭示了亚基因组不对称性在棉纤维发育过程中的新规律,为棉花纤维改良提供了理论参考。相关研究成果发表在《新植物学家(New Phytologist)》上。
棉花是世界上最重要的天然纺织纤维来源。棉花纤维发育涉及复杂的全基因组调控网络,但以往研究多局限于单个基因或小规模分析,缺乏系统性视角。
该研究收集分析了401份棉花纤维发育不同阶段的基因表达数据,构建了一个高质量的棉花纤维转录图谱。该图谱涵盖纤维伸长(初生壁合成)、初生壁向次生壁转换和次生壁加厚在内的3个关键时期。利用该图谱,研究人员进一步识别出了与纤维发育不同阶段密切相关的共表达模块和调控纤维发育的关键基因。研究还发现,棉花中存在着两套亚基因组(A和D)共同调控纤维发育,有趣的是,虽然D亚基因组提供的基因数量更多,但A亚基因组中的调控因子却发挥着更重要的作用。
该研究得到中国农业科学院科技创新工程、国家自然科学基金、广东省基础与应用基础研究等项目的资助。(通讯员 马昕怡)
原文链接:https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.70616