近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业宏基因组学创新团队构建了六倍体菊芋染色体级别参考基因组，解析了菊芋基因组起源和演化过程，为向日葵属作物的起源进化研究、抗逆基因挖掘、育种改良和工业化利用提供了宝贵的资源。相关研究成果发表在《植物通讯（Plant Communications）》上。
菊芋俗称洋姜，兼具生态防护和经济利用双重价值，然而菊芋基因组极其复杂，基因组的测序组装面临重复序列比例高、杂合度高、染色体数多等挑战，其六倍体基因组至今仍未破译。
研究人员利用测序等技术，完成了六倍体菊芋的高质量染色体级别组装，基因组组装大小为10.5 Gb，共含有199842个蛋白编码基因。研究首次发现，菊芋约2百万年前发生了全基因组三倍化事件，是菊芋形成六倍体的主要原因。
该研究得到国家重点研发计划、深圳市基础研究项目、深圳市重点实验室基金和农业科技创新计划的支持。（通讯员 马昕怡）
原文链接：
https://doi.org/10.1016/j.xplc.2023.100767
