未来5～15年是我国发展现代农业、建设社会主义新农村和创新型国家的重要历史时期，也是我院科学技术事业快速发展、努力实现“三个中心一个基地”战略目标的关键时期。为进一步明确我院“十一五”科学技术发展的战略定位、发展思路、目标任务和工作重点，提出有效对策与措施，全面提升自主创新能力，提高对发展现代农业、建设社会主义新农村和创新型国家的支撑能力，引领我国农业科学技术发展，特制定本规划。
一、形势与任务
（一）发展机遇
经济全球化步伐不断加快，要求农业科学技术发展从当前立足国内资源为主，向国际、国内资源并重的全球发展战略转变。
知识经济蓬勃兴起，为农业科学技术的大发展提供了新的机遇和更广阔的空间。
科技革命日新月异，以生物技术、信息技术、制造技术、工程技术等为代表的高新技术正在深刻改变传统农业的面貌，必将带来一场新的革命。
建设创新型国家的战略目标和历史任务，要求农业科学技术整体实力有新的突破，力争通过15年的努力，跃居世界先进行列。
建设社会主义新农村的根本是要坚持以发展农村经济为中心，促进农村生产力的解放和发展，核心是发展现代农业，提高农业综合生产能力，对农业科学技术提出了全新的历史任务和更高要求。
建设国家农业科技创新体系赋予中国农业科学院新的发展机遇，关键是要加强学科建设、人才与创新团队建设、基础设施与条件建设、现代院所制度与创新文化建设。
上述前所未有的良好机遇，标志着我国农业科学技术已经进入一个蓬勃发展的关键时期。
（二）任务与需求
保障粮食和食物安全是我国长期的战略任务。在淡水、耕地、能源等要素的刚性制约下，唯一的出路是提高单产，不断培育高产、优质、多抗的动植物新品种，发展适应不同生产、生态条件及种/养模式的农业生产技术体系，为国家粮食和食物安全提供可靠的科学技术保障。
增加农民收入是亟待破解的难题。要求围绕农产品生产、保鲜、加工、物流、销售等环节，大力发展经济效益好的特色种/养业技术，创新多梯次增加农产品附加值的综合生产、加工技术，不断延伸种植、养殖、农产品加工领域的价值链，拓展农民的增收渠道。
资源安全是可持续发展的基础。要求围绕土、肥、水、气、光、温、生物等资源的合理配置，创新农业资源高效利用技术、循环利用技术、降本增效技术和资源替代技术，建立适合中国自然与社会经济发展条件的农业资源高效利用技术体系。
生物安全是可持续发展的前提。要求针对动植物重大病虫草鼠害、人畜共患传染病、危险性外来病(动物)、外来入侵生物、转基因生物安全，在监测预警、检测诊断、快速扑灭和可持续控制技术等方面取得新突破，构建国家生物安全“防火墙”。
生态安全是可持续发展的保障。要求加强生态、环境、资源的预警和监测，创新生态环境保护、污染控制与修复技术
