记者23日从中国农业科学院获悉，该院完成首个北美沼生菰接近完整基因组的组装，为菰属作物遗传改良、功能基因解析和关键生物过程研究提供了宝贵的资源。相关研究成果日前发表在国际期刊《作物学报》上。

北美沼生菰基因组及其分析示意图

作为栽培稻的重要野生近缘种，北美沼生菰是一年生的水生特种作物，其籽粒（菰米）被誉为“谷物中的鱼子酱”。经历人为驯化的北美沼生菰产量相对较高，且形成了完整的种植、采收、加工和销售产业链。由于基因组质量的限制，北美沼生菰研究还相对较弱。

北美沼生菰花序

据论文通讯作者、中国农业科学院研究员闫宁介绍，该研究组装获得1.41Gb的北美沼生菰基因组，长末端重复组装指数为29.9。通过序列连接填充，将99.99%的组装序列锚定至15条染色体。研究发现，北美沼生菰与中国菰亲缘关系最近，两者分化时间为4.57–8.15百万年前，均经历全基因组复制，且存在明显的物种分化信号。该研究鉴定出两个与水稻植保素基因簇高度共线性的区段，其在北美沼生菰与中国菰基因组中均存在2个拷贝，由全基因组复制而来，并伴随着基因组片段化。